Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms