Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms