Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcc1P97496 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcc1P97496 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms