Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms