Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Irx1P81068 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Irx1P81068 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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