Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx3P81067 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx3P81067 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms