Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms