Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hoxd13P70217 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hoxd13P70217 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hoxd13P70217 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hoxd13P70217 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hoxd13P70217 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hoxd13P70217 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hoxd13P70217 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hoxd13P70217 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hoxd13P70217 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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