Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf5P70191 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf5P70191 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf5P70191 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms