Protein–RNA interactions for Protein: P63058

Thra, Thyroid hormone receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThraP63058 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThraP63058 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThraP63058 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThraP63058 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ThraP63058 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThraP63058 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThraP63058 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThraP63058 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ThraP63058 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
ThraP63058 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ThraP63058 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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ThraP63058 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ThraP63058 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThraP63058 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThraP63058 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThraP63058 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThraP63058 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThraP63058 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ThraP63058 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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