Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rps3P62908 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms