Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap25P60879 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap25P60879 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms