Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms