Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uchl4P58321 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms