Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp25P57080 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp25P57080 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp25P57080 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp25P57080 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp25P57080 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp25P57080 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp25P57080 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp25P57080 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp25P57080 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp25P57080 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp25P57080 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp25P57080 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp25P57080 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp25P57080 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp25P57080 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp25P57080 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp25P57080 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp25P57080 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp25P57080 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms