Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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