Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GemP55041 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GemP55041 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GemP55041 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GemP55041 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GemP55041 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GemP55041 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GemP55041 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GemP55041 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GemP55041 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GemP55041 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GemP55041 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GemP55041 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GemP55041 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GemP55041 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GemP55041 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GemP55041 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GemP55041 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GemP55041 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GemP55041 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GemP55041 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GemP55041 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GemP55041 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GemP55041 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GemP55041 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms