Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cux1P53564 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cux1P53564 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux1P53564 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux1P53564 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux1P53564 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cux1P53564 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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