Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efnb1P52795 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms