Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox5P52651 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox5P52651 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox5P52651 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rhox5P52651 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Rhox5P52651 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhox5P52651 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhox5P52651 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhox5P52651 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox5P52651 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rhox5P52651 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox5P52651 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rhox5P52651 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox5P52651 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rhox5P52651 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox5P52651 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox5P52651 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox5P52651 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox5P52651 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox5P52651 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox5P52651 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox5P52651 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox5P52651 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox5P52651 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox5P52651 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox5P52651 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox5P52651 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox5P52651 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox5P52651 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox5P52651 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox5P52651 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox5P52651 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox5P52651 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox5P52651 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox5P52651 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox5P52651 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox5P52651 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox5P52651 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox5P52651 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox5P52651 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rhox5P52651 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox5P52651 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox5P52651 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox5P52651 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox5P52651 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox5P52651 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox5P52651 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox5P52651 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox5P52651 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox5P52651 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox5P52651 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox5P52651 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox5P52651 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox5P52651 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox5P52651 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox5P52651 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox5P52651 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox5P52651 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox5P52651 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox5P52651 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox5P52651 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox5P52651 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox5P52651 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox5P52651 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms