Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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CcnfP51944 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CcnfP51944 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CcnfP51944 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CcnfP51944 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CcnfP51944 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CcnfP51944 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CcnfP51944 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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