Protein–RNA interactions for Protein: P50707

Defa9, Alpha-defensin 9, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa9P50707 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa9P50707 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa9P50707 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa9P50707 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa9P50707 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa9P50707 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa9P50707 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms