Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SftpbP50405 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SftpbP50405 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SftpbP50405 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpbP50405 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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