Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms