Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpreP49446 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpreP49446 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpreP49446 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PtpreP49446 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PtpreP49446 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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PtpreP49446 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PtpreP49446 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PtpreP49446 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PtpreP49446 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpreP49446 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpreP49446 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpreP49446 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms