Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atoh1P48985 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atoh1P48985 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms