Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms