Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig1P37913 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig1P37913 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms