Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddit3P35639 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddit3P35639 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddit3P35639 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddit3P35639 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddit3P35639 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddit3P35639 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddit3P35639 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddit3P35639 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddit3P35639 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddit3P35639 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddit3P35639 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddit3P35639 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddit3P35639 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddit3P35639 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddit3P35639 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddit3P35639 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddit3P35639 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddit3P35639 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddit3P35639 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddit3P35639 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddit3P35639 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddit3P35639 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddit3P35639 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddit3P35639 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddit3P35639 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddit3P35639 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddit3P35639 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddit3P35639 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms