Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab20P35295 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab20P35295 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab20P35295 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab20P35295 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab20P35295 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab20P35295 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab20P35295 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab20P35295 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab20P35295 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab20P35295 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab20P35295 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab20P35295 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab20P35295 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab20P35295 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab20P35295 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab20P35295 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab20P35295 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab20P35295 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab20P35295 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab20P35295 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab20P35295 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab20P35295 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab20P35295 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab20P35295 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab20P35295 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab20P35295 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab20P35295 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab20P35295 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab20P35295 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab20P35295 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab20P35295 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab20P35295 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab20P35295 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab20P35295 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab20P35295 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab20P35295 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab20P35295 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab20P35295 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab20P35295 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab20P35295 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab20P35295 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab20P35295 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab20P35295 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab20P35295 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab20P35295 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab20P35295 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab20P35295 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rab20P35295 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rab20P35295 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab20P35295 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab20P35295 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab20P35295 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab20P35295 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab20P35295 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab20P35295 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab20P35295 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab20P35295 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab20P35295 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab20P35295 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab20P35295 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab20P35295 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab20P35295 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab20P35295 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab20P35295 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab20P35295 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab20P35295 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab20P35295 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab20P35295 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab20P35295 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab20P35295 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab20P35295 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab20P35295 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab20P35295 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab20P35295 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab20P35295 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab20P35295 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab20P35295 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab20P35295 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab20P35295 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab20P35295 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab20P35295 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab20P35295 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms