Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms