Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pola2P33611 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pola2P33611 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pola2P33611 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms