Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms