Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrgP28705 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrgP28705 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms