Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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