Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms