Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms