Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms