Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lef1P27782 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lef1P27782 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lef1P27782 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lef1P27782 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Lef1P27782 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lef1P27782 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Lef1P27782 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Lef1P27782 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lef1P27782 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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Lef1P27782 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lef1P27782 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Lef1P27782 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Lef1P27782 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lef1P27782 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lef1P27782 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lef1P27782 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lef1P27782 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lef1P27782 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lef1P27782 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lef1P27782 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lef1P27782 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lef1P27782 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lef1P27782 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lef1P27782 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lef1P27782 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lef1P27782 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lef1P27782 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lef1P27782 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lef1P27782 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lef1P27782 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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