Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde6aP27664 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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