Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl3P27659 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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