Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nfkb1P25799 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms