Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NdnP25233 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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NdnP25233 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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NdnP25233 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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NdnP25233 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NdnP25233 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NdnP25233 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NdnP25233 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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NdnP25233 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NdnP25233 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NdnP25233 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NdnP25233 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NdnP25233 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NdnP25233 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NdnP25233 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NdnP25233 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NdnP25233 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NdnP25233 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NdnP25233 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NdnP25233 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NdnP25233 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NdnP25233 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NdnP25233 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NdnP25233 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NdnP25233 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NdnP25233 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NdnP25233 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NdnP25233 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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