Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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