Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms