Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RargP18911 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RargP18911 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RargP18911 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RargP18911 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RargP18911 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RargP18911 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RargP18911 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RargP18911 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RargP18911 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RargP18911 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RargP18911 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RargP18911 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RargP18911 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RargP18911 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RargP18911 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RargP18911 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RargP18911 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RargP18911 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RargP18911 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RargP18911 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RargP18911 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RargP18911 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RargP18911 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RargP18911 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RargP18911 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RargP18911 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RargP18911 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RargP18911 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RargP18911 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RargP18911 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RargP18911 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RargP18911 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RargP18911 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RargP18911 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RargP18911 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RargP18911 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RargP18911 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RargP18911 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RargP18911 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RargP18911 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RargP18911 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RargP18911 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RargP18911 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RargP18911 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RargP18911 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RargP18911 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RargP18911 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RargP18911 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RargP18911 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms