Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
P18530 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18530 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18530 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18530 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18530 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18530 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18530 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18530 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18530 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18530 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18530 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18530 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18530 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18530 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18530 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18530 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18530 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18530 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18530 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18530 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18530 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18530 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18530 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18530 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18530 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18530 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18530 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18530 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18530 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms