Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcna1P16388 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms