Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhoP15409 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RhoP15409 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RhoP15409 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RhoP15409 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RhoP15409 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RhoP15409 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RhoP15409 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RhoP15409 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RhoP15409 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RhoP15409 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RhoP15409 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RhoP15409 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RhoP15409 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RhoP15409 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RhoP15409 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RhoP15409 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RhoP15409 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RhoP15409 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RhoP15409 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RhoP15409 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RhoP15409 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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