Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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